Elysium (von griech. Elysion - "Insel der Seligen") war eine unterirdische Bunkeranlage und Zuflucht der Menschheit vor der Faro-Plage. Im Gebiet von Utah oder Ontario gelegen (es gibt eine Notiz, dass der Bunker nur wenige Meilen von GAIA Prime liegt), diente Elysium ab 2066 als Rückzugsort für die verbliebenen Mitarbeiter von Projekt Zero Dawn und ihre Familien.
Elysium hatte dabei aber lediglich den Zweck, seinen Bewohnern ihre normale Lebenserwartung zu sichern. Es war ausdrücklich nicht als Mehrgenerationenbunker konzipiert. Elysium war lediglich Anreiz und Belohnung für jene, die sich bereit erklärten, Zero Dawn wahr werden zu lassen. Im Gegenzug konnten sie zwei Familienangehörige oder Personen ihrer Wahl nennen, die zusammen mit ihnen den unmittelbaren Untergang der Menschheit für einige Jahrzehnte überleben sollten.
Die Anlage war für einen Betrieb von etwa 100 Jahren und für 2000 Bewohner ausgelegt. Gaia zufolge ging Elysium jedoch aus unbekannten Gründen bereits knapp 30 Jahre nach der Versiegelung abrupt und ohne Vorwarnung offline und ist es seitdem geblieben. Seine Bewohner erlitten also wahrscheinlich ein tragisches Schicksal, auch wenn sie der Faro Plage selbst entkamen. In welchem Zustand sich der Bunker nach 974 Jahren befindet, ist unbekannt, genau wie sein Standort.
Ebenso unbekannt ist, wie viele solcher Zufluchtsstätten es weltweit gab. Eine weitere bekannte Anlage ist Theben, der pyramidenförmige Privatbunker von Ted Faro.